专访｜凭基因排序揪出变种病毒　病毒猎人萧杰恒：政府应协调统筹

新冠肺炎肆虐香港近一年半，追踪传播链的“功臣”除了人所共知的卫生防护中心传染病处主任张竹君外，理工大学、香港大学一众化验师亦默默耕耘，透过基因排序去揭露患者关系，最成功的一次莫过于找到南非变种病毒由印裔男子传播予数名菲佣，堵截了传播。　
带领理工大学团队的医疗科技及资讯学系副教授萧杰恒接受《香港01》专访，明言由于欠缺政府统筹，在疫情初期基因排序滞后，只能在爆发出现后“解释返个故事”，现时虽然因应技术进步而加快了流程，但仍未能为所有确诊个案做基因排序，提倡政府协调各间大学合作，以基因排序去堵截新一波疫情出现。

病毒猎人萧杰恒系列报道：

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今年5月1日，理工大学和香港大学同日公布，带有南非变种病毒的印度裔男子之病毒基因，原来与东涌映湾园的菲佣相同，揭发二人之间有传播关系，进而迫使到印裔男子披露他曾参加女友人的家庭聚会，或再由女友人兄长一家传播病毒予三名菲佣。

萧杰恒直言，今次透过基因排序找到变种病毒在香港之传播链，是疫情爆发以来最成功的一次，“喺未扩散之前揾到条传播链，将佢成条揪出嚟。”

说起这次成功经验，萧杰恒难掩兴奋，因为在疫情初期，基因排序只能像“事后孔明”，用作验证和解释一些已知的传播，例如去年4月理大才公布，透过基因排序发现第一波（去年1、2月）疫情中佛堂群组的“零号病人”应该是住持。直到去年7月初出现第三波疫情时，萧杰恒利用基因排序，找出漏洞在于政府豁免了海员和机组人员检疫，令政府收紧相关政策。他感叹虽然7月底找出了社区大爆发的导火线，可惜为时已晚，只能“堵塞返个漏洞”。

及至去年10月，萧杰恒察觉到本港有新品种病毒株传入，警告第四波随时一触即发，讵料病毒真的碰上了跳舞群组，形成本港最大的确诊群组。他坦言，当社区出现大爆发后，基因排序便会变得“无甚作为”，因为基本上所有个案的基因都非常相似，难以分辨到如何传播。

想取得一个样本作基因排序却难关重重

基因排序要做得够快、够多才能发挥作用，阻截传播，但偏偏萧杰恒想取得一个样本却难关重重，需先推测病人留医的医院，再自行联络院方索取样本，曾试过花费5、6天才能取得一个样本。疫情爆发近一年半，本港共有近一万二千宗确诊个案，萧杰恒只能取得当中约1800个样本作化验，因部分样本病毒量不足，最终只有1400个可做到基因排序，“好多时见到有啲个案有特别嘅突变，但当中断咗片，究竟无啦啦点解多咗呢个突变？佢喺边度嚟嘅呢？唔可以将唔同群组串连一齐。”

▼基因排序电脑分析三部曲▼

萧杰恒不讳言指，在基因排序方面，香港落后于其他国家，因为政府不够重视这项技术，遇到有怀疑个案时，会先确定该人士确诊，再追踪其密切接触者，“第三位先系基因排序”，投放的资源亦不多。相反，新西兰会为所有确诊个案做基因排序，而英国更会每周公布不同地区的病毒品种。

尽快为所有个案基因排序　唔使估源头喺边度，边度有漏洞

早前有专家指本港第四波疫情已完结，但昨天再现一宗本地源头不明个案（35岁男警），萧杰恒认为，本港疫情仍有暗涌，政府更应衬第五波未出现前重新布防，外防输入。他提倡政府担起统筹角色，协调各间大学分工合作，为所有确诊个案做基因排序，相信一旦本地再有个案，亦可即时对比输入个案，“唔使估源头喺边度，边度有漏洞…如果唔系就净系知确诊个案一路升紧，咁究竟系原本传播链蔓延，定系有新嘅传播链存在？”

他并建议政府于机场设置小型基因测序仪器，每当有入境者的样本初步阳性，便即时做基因排序，料只需8至11小时便可得出全基因图谱。