变种病毒|理大基因排序分析 揭社区恐现两条变种病毒传播链
南非变种病毒袭港,理工大学的基因排序发现,东涌映湾园菲佣(第11773宗)、菲佣照顾的10个月大女婴(第11774宗)和佐敦伯嘉士大厦的印裔男子(第11643宗)的病毒基因100%相同。
团队指出,结果反映印裔男和东涌菲佣之间有传播关系,但到底如何传播、中间隔了多少代传播者,都仍是未知之数,社区中或有不少隐形传播者。
团队又指,另一个变种病毒个案、居于坚尼地道8号的菲佣的基因与印裔男完全不同,而这名菲佣曾进入社区,代表社区中或有两条变种病毒的传播链。
理工大学医疗科技及资讯学系副教授萧杰恒表示,他和团队在4月做了50多个样本的病毒基因排序分析,昨晚通宵分析东涌映湾园菲佣的个案,结果发现她是感染南非变种病毒(B.1.351),再将她和其他南非变种病毒个案的基因作比对,证实与印裔男100%相同,并无突变。
他称,自去年9月30日发现中环IFC一名厨师感染到尼泊尔病毒株(B.1.36.27)后,该款病毒株一直在港传播,跳舞群组及近月的本地个案都属这款病毒株,而IFC厨师和跳舞群组个案的病毒基因都是100%相同,反映他们是同一感染源头,个案之间有传播关系。现时发现到印裔男和东涌菲佣的病毒基因100%相同,也意味两人之间有传播关系。
不过,印裔男与东涌外佣都无到过同一地点,到底二人之间如何传播?他直言或非直接传播,而是中间有几代的传播者,他解释,由9月至今的尼泊尔病毒株在传播时,也只是出现了数颗病毒突变,代表即使病毒传了好多代,其基因仍有可能100%相同。他坦言希望两人之间只是相隔两、三代,但中间的传播链是如何形成,仍有待卫生防护中心去追查。
印裔男在检疫时入住尖沙咀华美达酒店,当局曾怀疑该酒店同层的检疫人士传染到印裔男,萧杰恒取得该酒店4个病人样本,但当中3人病毒量太低,不能分析,第11550宗个案是唯一可以做到基因排序到的个案,但结果发现这宗个案与印裔男虽然都是感染南非变种病毒,但非完全一样,估计并非印裔男的感染源头,但亦不能完全排除印裔男在酒店受感染。至于印裔男的女性朋友,他无取得该病人的样本,未知基因是否完全相同。
▼4月29日,东涌映湾园第11座封区检测,涉变种病毒个案▼
另一方面,本港另一宗出现在社区的变种病毒个案是居于坚尼地道8号的菲佣,萧杰恒称,这宗个案的病毒基因显示她都有南非变种病毒,但与印裔男之间的差异更大,二人的基因突变多于十颗。他解释,一般病毒每个月只会有一、两颗突变,因此当突变多于十颗时,“应该可以否定两人之间有关。”而这名菲佣所住的西营盘华美达酒店,他取了8个样本,另外的7人与这名外佣都不相同,找不到她在酒店内受到感染的证据,他估计这名菲佣在原居地受感染的可能性较大,因为其病毒排序较接近原始南非病毒株,而且她入院时病毒量低,CT值达到38,体内亦已有抗体,料感染日至确诊日之间相距8天以上。
萧杰恒又指出,坚尼地道8号的菲佣曾在社区逗留数天才确诊,不排除在社区内有造成传播;而印裔男亦有传染到他人,因此社区内有可能有两条变种病毒传播链。他同意政府要求所有外佣检测,因为来自菲律宾的患者大多感染南非变种病毒,属较高风险。