IVE生物科技毕业生研发透过检测泥土DNA 鉴定树木真菌品种助诊治
热带风暴浪卡上周吹袭香港,本港天文台早前预测今年风季将有4至7个台风,11月仍有机会有台风袭港。
受真菌感染的树木容易被强风吹倒造成意外,5名香港专业教育学院(IVE)生物科技高级文凭毕业生,花约半年时间,成功研发快速鉴定树木真菌品种的DNA检测方法,以及早预防、诊断和治疗受感染的树木。该研究项目早前于职业训练局(VTC)主办的“创意x应用”计划中夺“卓越大奖”。
现时树艺师主要以目测方法辨识树木受感染的真菌品种,或将菇菌及其孢子交由实验室检测,但上述方法或不够准确,同时要待真菌长成菇时,才能辨识问题,错过治疗树木的最佳时机。
而由IVE生物科技高级文凭毕业生邹俊杰、欧家杰、程浩钿、林逸华和何耀忠组成的研究团队,成功研发以检测泥土DNA,鉴定树木真菌。团队成员邹俊杰解释,由于部分高危真菌在长成菇菌前,已对树木结构造成一定破坏,因此团队想尽早得知树木受哪种真菌感染,遂研究以泥土检验方法取得真菌的DNA,及早判断真菌种类。
邹俊杰指,团队从泥土样本取得真菌DNA后,再利用分子生物技术复制并检测泥土中真菌DNA的序列,然后与基因资料库中的真菌DNA序列作对比,从而分析存在于泥土中的真菌品种。
过程中加入“纳米金粒子” 进行逾500次测试以确保准确性
另一成员欧家杰指,研发期间经历不少挑战,例如由于泥土含有不少化学物质会阻碍分子诊断,团队于是参考大量文献,发现在复制DNA过程中加入“纳米金粒子”,能将复制DNA的灵敏度提升10倍,有助解决泥土中杂质带来的假阴性问题,提升测序成功率达三成。何耀忠指,过程中最具挑战的部分在于找出检测过程中“纳米金粒子”的合适份量和浓度等。团队花近半年时间,利用不同泥土样本完成超过500次测试,才能确保测试的准确性。
未来将继续改良技术 日后应用于树艺及检测业界
团队研发的检测方法,可准确检验普遍存在于泥土的真菌外,亦能验出一些可能引致树木腐朽的真菌品种,包括Trametes cubensis(古巴栓孔菌)及Ganoderma gibbosum(有柄树舌灵芝)等。负责带领学生进行今次研究的IVE(柴湾)应用科学系高级讲师卢廷诗表示,现时业界较少利用泥土来检测树木真菌,未来学系将继续改良技术,提升其灵敏度,冀望技术日后可应用于树艺及检测业界。